Этот способ размножения еще называют семенным (мхи и папоротники размножаются спорами).

В природе он играет очень важную роль в жизни растений: часто более важную, чем вегетативный способ размножения, поскольку дает возможность семенам распространиться на значительную территорию, кроме того, в этом случае пара растений дает несколько десятков, а то и сотен семян. Также семена растений обычно устойчивы к различным заболеваниям растений, а также к «капризам окружающей среды», что дает возможность растению сохраниться, когда погибает материнская поросль.

В аквариумистике же этот метод применяется гораздо реже. В биотопах чаще всего семенное размножение применяют к апоногетонам, реже — к барклайям, кубышкам, оттелия, кувшинкам, эхинодорусам.

Стадии генеративного размножения: опыление, образование семян в оплодотворенных цветках, проращивание семян, проращивание поросли.

Опыление часто проводят искусственно: пыльцу с растения на растение переносят мягкой кисточкой, а при самоопылении проводят по тычинкам и пестикам чистым пальцем.

Обычно семена аквариумных растений небольшие, и не превышают в диаметре 3 мм, хотя встречаются и крупные плоды.
Семена растений могут сохранять всхожесть достаточно длительное время. Часто они сохраняются зиму или засушливый период и прорастают в течение следующего за ними вегетационного периода.
Чтобы семена водных растений не прорастали, их можно хранить в сухом виде. Однако семена не всех гидробионтов это выдерживают: некоторые из них требуют постоянного нахождения в воде при определенной температуре. Например, семена водных растений средней полосы хранятся только в воде при температуре не выше 4 градусов по Цельсию. При более высоких температурах они начинают прорастать. Для соблюдения такого температурного режима в домашних условиях необходимы специальные холодильные установки или термостаты.
Также нельзя хранить в сухом виде семена семейства апоногетоновых: они могут погибнуть.

Существует простой способ сохранения семян, растений с «зимующими» листьями, спор в домашних условиях: их помещают в плетеную корзиночку или стеклянную банку, закрывают перфорированной крышкой, опускают на дно ближайшего к дому, чистого водоема. Весной корзиночку достают, а семена высаживают в грунт.

Сложнее обстоит дело с семенами, хранящимися в сухом виде. Прорастить их труднее, чем семена, хранившиеся во влажной среде. Это вызвано тем, что у семян, хранящихся сухими, более твердая оболочка, сросшаяся с семенем, и разделить их подчас нелегко. Некоторые виды водных растений даже дают семена в виде орешков со скорлупой, которую необходимо осторожно расколоть, извлечь из нее семечко, поместить в ком глины и высадить в грунт.
У многих видов сухие семена, даже не представляющие собой «орешки», расковыривают или делают надрезы над местом нахождения зародыша, для улучшения и ускорения их всхожести.

Перед посадкой сухие семена обрабатывают в растворе калиевой соли — гетероауксине.
0, 5 таблетки гетероауксина, 100 мг основного вещества, растворяется в 1 литре питьевой воды комнатной температуры. Выдержка: 6-8 часов. Обработка должна проводиться при комнатной температуре, а также рассеянном свете.
Затем семена проращивают в стеклянной круглой баночке, с отстоянной питьевой водой, диаметром 10 см и высотой 20 мм. Эта баночка сверху накрывается стеклянной крышкой и стоит в теплом месте (температура воды 24-25 градусов) с рассеянным светом.

Проросшую поросль также высаживают в грунт, в стеклянную банку с отстоянной водой или в плошку. Грунт делают из крупнозернистого речного песка или мелкого гравия с незначительным добавлением шамотной глины и торфяной крошки. Слой грунта должен быть не менее 3 см. Освещение делают очень ярким
Высаживают семена в грунт, делая стеклянной палочкой ямки и борозды. Если грунт имеет в своем составе глину, то семена высевают на меньшую глубину. Крупные семена высаживают глубже, чем мелкие. В целом, глубина посадки семян: 2-5 мм, реже — 10 мм.

При прорастании семян особое внимание стоит уделить борьбе с водорослями, так как водоросли могут уничтожить молодую поросль.