Размножение водных и болотных растений играет большую роль в жизни биотопа.

На рост и развитие растения влияет много факторов: химические показатели воды, физические показатели воды (в первую очередь, температура), свет, грунт, уход за растениями.

Такие показатели как рН, жесткость, температура очень важны не только для рыб, но и для растений.
Жесткость во многих природных водоемах сильно отличается от аквариумной воды, а ежесуточные колебания рН в густо-засаженном травнике могут стать причиной болезней растений.
Хороший грунт и правильно подобранный свет — необходимые условия не только размножения, но и нормального роста растений. При размножении черенками и отрезками корневища, высаживаемые в грунт побеги намного быстрее дают новые корешки в сбалансированном и правильно подобранном грунте. Это же относится и к проращиванию семян при семенном размножении растений.
То же самое можно сказать о свете и температуре воды: хорошее освещение и правильно подобранная температура — залог успешного размножения.

Есть у молодых растений и злейшие враги — водоросли. Необходимо оберегать молодые побеги от их воздействия.

Существует два общепризнанных метода размножения водных и болотных растений в биотопах: вегетативный и генеративный.

Вегетативный способ подразумевает получение нового ростка из уже существующих частей растения: листа, стебля, корневища, клубня, отростка. Данную часть высаживают в грунт, после чего она укореняется и дает новое растение. Предварительно можно ее обработать специальным раствором для лучшего роста.

Генеративный способ — семенной. При нем необходимо опыление цветков и получение семян.
В силу ряда причин на практике этот метод применяется гораздо реже:

— аквариумисту гораздо проще размножить большинство видов вегетативным способом;

— далеко не у каждого аквариумиста водные растения в биотопе цветут: правильный уход за растениями, при котором они начнут цвести, достаточно сложен;

— в аквариуме существуют определенные сложности с опылением, ввиду его небольших размеров, а также отсутствия естественных условий для опыления; мхи и папоротники в аквариумах, без специальной подготовки практически не размножаются половым способом;

— даже если удастся получить семена, могут быть определенные сложности с их проращиванием.

Тем не менее, апоногетоны  и некоторые виды эхинодорусов размножаются именно таким способом.
Ученые изобретают и другие способы размножения водных растений.
Например, в 60-е годы Ж. Морель разработал метод меристемного размножения.
Меристема — растительная ткань, способная регенерировать, образовывать новые растения, аналогичные материнскому.

Упрощенно схема выглядит так. От материнского растения берут меристему (соматические клетки, способные дать жизнь новому растению). В особых условиях развивают и наращивают ее до получения «готовых» органов: почек, стеблей или других. Далее выращивают новые растения.
Метод требует точного знания местонахождения меристемических тканей у каждого вида растения, а также условий, при которых они будут развиваться.

Однако этот метод пока что трудно воспроизводим в домашних условиях, уже хотя бы потому, что требует полной стерильности помещения: присутствие вирусов, бактерий, водорослей и грибов должно быть исключено; специальной посуды, инструментов, питательных сред.

Тем не менее, в условиях НИИ и других специальных ботанических лабораториях метод вполне применяется.